Duke Nukem 3D nečekaně navazuje na své dva předchozí díly, oproti nim ovšem v již lákavější 3D podobě (což si vývojáři pro jistotu dali i do názvu). Pokud sérii Duke Nuken znáte, netřeba Vám představovat hlavní postavu, za kterou budete zabíjet skoro vše, co se jen hýbá. V tomto díle se podíváte do velmi pestrým lokací – Los Angeles, okolní propasti a podzemí, prostory ve vesmíru a nakonec do samotného Japonska.